Mit dem Else Kröner Fresenius Zentrum für Ernährungsmedizin in Weihenstephan und München fördert die EKFS eine interfakultative Einrichtung, die ganzheitliche Präventionsforschung betreibt und diese Forschungsergebnisse in die ambulante Praxis umsetzt.

Das Else Kröner Fresenius Zentrum für Digitale Gesundheit wurde im September 2019 ins Leben gerufen. Ziel des Zentrums ist es, das Potenzial der Digitalisierung in der Medizin und damit für eine bessere Patientenversorgung zu erschließen.

Im Oktober 2022 wurde das Else Kröner Fresenius Zentrum für Nephrologische Forschung gegründet. Mit der Etablierung dieses Zentrums am Universitätsklinikum Frankfurt legt die EKFS den Grundstein, die Nierenforschung am Fachbereich Nephrologie maßgeblich zu stärken und zu unterstützen.

Ein viertes Else Kröner Fresenius Zentrum für Medizinische Forschung ist seit Januar 2023 ausgeschrieben.